Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH1

Ube2dnl1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D N-terminal-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl1A2AFH1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2dnl1A2AFH1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2dnl1A2AFH1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms