Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms