Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Itgb4A2A863 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Itgb4A2A863 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Itgb4A2A863 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Itgb4A2A863 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Itgb4A2A863 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Itgb4A2A863 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Itgb4A2A863 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Itgb4A2A863 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Itgb4A2A863 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Itgb4A2A863 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Itgb4A2A863 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Itgb4A2A863 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Itgb4A2A863 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Itgb4A2A863 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Itgb4A2A863 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Itgb4A2A863 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Itgb4A2A863 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Itgb4A2A863 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itgb4A2A863 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itgb4A2A863 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itgb4A2A863 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itgb4A2A863 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itgb4A2A863 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itgb4A2A863 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itgb4A2A863 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Itgb4A2A863 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Itgb4A2A863 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Itgb4A2A863 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Itgb4A2A863 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Itgb4A2A863 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Itgb4A2A863 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Itgb4A2A863 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Itgb4A2A863 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Itgb4A2A863 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Itgb4A2A863 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Itgb4A2A863 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Itgb4A2A863 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Itgb4A2A863 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Itgb4A2A863 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Itgb4A2A863 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Itgb4A2A863 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Itgb4A2A863 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Itgb4A2A863 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Itgb4A2A863 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Itgb4A2A863 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Itgb4A2A863 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Itgb4A2A863 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Itgb4A2A863 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Itgb4A2A863 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Itgb4A2A863 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Itgb4A2A863 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Itgb4A2A863 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Itgb4A2A863 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Itgb4A2A863 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Itgb4A2A863 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Itgb4A2A863 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Itgb4A2A863 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Itgb4A2A863 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Itgb4A2A863 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Itgb4A2A863 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Itgb4A2A863 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms