Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Prdm2A2A7B5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Prdm2A2A7B5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Prdm2A2A7B5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Prdm2A2A7B5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Prdm2A2A7B5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Prdm2A2A7B5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Prdm2A2A7B5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Prdm2A2A7B5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Prdm2A2A7B5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Prdm2A2A7B5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Prdm2A2A7B5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Prdm2A2A7B5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Prdm2A2A7B5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Prdm2A2A7B5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Prdm2A2A7B5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Prdm2A2A7B5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prdm2A2A7B5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prdm2A2A7B5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prdm2A2A7B5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Prdm2A2A7B5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prdm2A2A7B5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prdm2A2A7B5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prdm2A2A7B5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prdm2A2A7B5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prdm2A2A7B5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prdm2A2A7B5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prdm2A2A7B5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prdm2A2A7B5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Prdm2A2A7B5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prdm2A2A7B5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prdm2A2A7B5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Prdm2A2A7B5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Prdm2A2A7B5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Prdm2A2A7B5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prdm2A2A7B5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prdm2A2A7B5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Prdm2A2A7B5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Prdm2A2A7B5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prdm2A2A7B5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prdm2A2A7B5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prdm2A2A7B5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Prdm2A2A7B5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prdm2A2A7B5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prdm2A2A7B5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prdm2A2A7B5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms