Protein–RNA interactions for Protein: A2A6C4

Sppl2c, Signal peptide peptidase-like 2C, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2cA2A6C4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sppl2cA2A6C4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sppl2cA2A6C4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sppl2cA2A6C4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sppl2cA2A6C4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sppl2cA2A6C4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sppl2cA2A6C4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sppl2cA2A6C4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Sppl2cA2A6C4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms