Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul4bA2A432 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms