Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms