Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc173A0JLY1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms