Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WR25

Gm28360, Predicted gene 28360, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28360A0A087WR25 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm28360A0A087WR25 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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