Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPJ1

1700017N19Rik, RIKEN cDNA 1700017N19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms