Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms