Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nme3Q9WV85 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms