Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms