Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ercc4Q9QZD4 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ercc4Q9QZD4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ercc4Q9QZD4 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ercc4Q9QZD4 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ercc4Q9QZD4 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ercc4Q9QZD4 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ercc4Q9QZD4 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ercc4Q9QZD4 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ercc4Q9QZD4 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ercc4Q9QZD4 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ercc4Q9QZD4 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Ercc4Q9QZD4 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ercc4Q9QZD4 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ercc4Q9QZD4 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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