Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT9

Znf354b, Zinc finger protein 354B, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354bQ9QXT9 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Gm28199-201ENSMUST00000187127 619 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Vmn1r210-201ENSMUST00000072044 921 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Gm20659-201ENSMUST00000176599 604 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Znf354bQ9QXT9 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf354bQ9QXT9 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf354bQ9QXT9 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf354bQ9QXT9 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf354bQ9QXT9 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf354bQ9QXT9 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf354bQ9QXT9 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf354bQ9QXT9 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf354bQ9QXT9 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf354bQ9QXT9 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf354bQ9QXT9 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms