Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap3b2Q9JME5 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap3b2Q9JME5 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap3b2Q9JME5 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap3b2Q9JME5 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap3b2Q9JME5 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap3b2Q9JME5 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap3b2Q9JME5 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap3b2Q9JME5 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap3b2Q9JME5 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap3b2Q9JME5 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap3b2Q9JME5 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap3b2Q9JME5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap3b2Q9JME5 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ap3b2Q9JME5 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ap3b2Q9JME5 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ap3b2Q9JME5 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ap3b2Q9JME5 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms