Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms