Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.4 ms