Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms