Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms