Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Tspan4Q9DCK3 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Tspan4Q9DCK3 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Tspan4Q9DCK3 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Tspan4Q9DCK3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Tspan4Q9DCK3 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Tspan4Q9DCK3 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Tspan4Q9DCK3 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Tspan4Q9DCK3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tspan4Q9DCK3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tspan4Q9DCK3 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tspan4Q9DCK3 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Tspan4Q9DCK3 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tspan4Q9DCK3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Tspan4Q9DCK3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tspan4Q9DCK3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tspan4Q9DCK3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tspan4Q9DCK3 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tspan4Q9DCK3 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tspan4Q9DCK3 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tspan4Q9DCK3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tspan4Q9DCK3 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tspan4Q9DCK3 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tspan4Q9DCK3 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tspan4Q9DCK3 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tspan4Q9DCK3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tspan4Q9DCK3 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tspan4Q9DCK3 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tspan4Q9DCK3 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tspan4Q9DCK3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Tspan4Q9DCK3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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