Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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