Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms