Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms