Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Cldn22Q9D7U6 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Cldn22Q9D7U6 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Cldn22Q9D7U6 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Cldn22Q9D7U6 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Cldn22Q9D7U6 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Cldn22Q9D7U6 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
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