Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Snx20Q9D2Y5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Snx20Q9D2Y5 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Snx20Q9D2Y5 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Snx20Q9D2Y5 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms