Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 2948.8 ms