Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms