Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms