Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms