Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms