Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Use1Q9CQ56 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Use1Q9CQ56 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
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Use1Q9CQ56 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Use1Q9CQ56 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
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Use1Q9CQ56 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Use1Q9CQ56 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Use1Q9CQ56 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Use1Q9CQ56 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Use1Q9CQ56 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Use1Q9CQ56 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Use1Q9CQ56 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Use1Q9CQ56 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Use1Q9CQ56 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms