Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Hdac9Q99N13 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Hdac9Q99N13 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Hdac9Q99N13 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Hdac9Q99N13 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
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Hdac9Q99N13 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Hdac9Q99N13 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdac9Q99N13 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms