Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Slc8b1Q925Q3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Slc8b1Q925Q3 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Slc8b1Q925Q3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Slc8b1Q925Q3 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Slc8b1Q925Q3 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Slc8b1Q925Q3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Slc8b1Q925Q3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Slc8b1Q925Q3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Slc8b1Q925Q3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Slc8b1Q925Q3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Slc8b1Q925Q3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Slc8b1Q925Q3 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Slc8b1Q925Q3 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Slc8b1Q925Q3 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Slc8b1Q925Q3 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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