Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Vmn1r180-201ENSMUST00000173816 5060 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Map2-204ENSMUST00000114013 6258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Fam83c-201ENSMUST00000029143 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Epas1-201ENSMUST00000024954 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Cdkn1b-202ENSMUST00000067327 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Mecp2-205ENSMUST00000170481 10175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Pla2g4e-201ENSMUST00000090071 4477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Ccdc171-201ENSMUST00000053414 4525 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Hecw2-203ENSMUST00000120904 11263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Atg7-201ENSMUST00000032457 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 H6pd-202ENSMUST00000084117 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Slc38a1-203ENSMUST00000100262 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Pogz-204ENSMUST00000107269 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Med1-201ENSMUST00000018304 5845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Synj2-209ENSMUST00000115790 4808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Adarb2-201ENSMUST00000064473 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Mid1-204ENSMUST00000112104 3860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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