Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Csmd1Q923L3 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms