Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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