Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW2

Cacng8, Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng8Q8VHW2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cacng8Q8VHW2 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cacng8Q8VHW2 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cacng8Q8VHW2 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cacng8Q8VHW2 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cacng8Q8VHW2 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms