Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Smg8Q8VE18 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Smg8Q8VE18 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Smg8Q8VE18 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Smg8Q8VE18 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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