Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a20aQ8VDB9 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms