Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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