Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
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