Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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FgbQ8K0E8 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
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FgbQ8K0E8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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FgbQ8K0E8 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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FgbQ8K0E8 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
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FgbQ8K0E8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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FgbQ8K0E8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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FgbQ8K0E8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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FgbQ8K0E8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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