Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Usp27Q8CEG8 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Usp27Q8CEG8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Usp27Q8CEG8 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Usp27Q8CEG8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms