Protein–RNA interactions for Protein: Q8C735

Lin9, Protein lin-9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin9Q8C735 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin9Q8C735 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms