Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Amigo3Q8C2S7 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Amigo3Q8C2S7 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Amigo3Q8C2S7 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Amigo3Q8C2S7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Amigo3Q8C2S7 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Amigo3Q8C2S7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Amigo3Q8C2S7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Amigo3Q8C2S7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Amigo3Q8C2S7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Amigo3Q8C2S7 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Amigo3Q8C2S7 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Amigo3Q8C2S7 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Amigo3Q8C2S7 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Amigo3Q8C2S7 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Amigo3Q8C2S7 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Amigo3Q8C2S7 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Amigo3Q8C2S7 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms