Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms