Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms