Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Atg4bQ8BGE6 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Atg4bQ8BGE6 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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