Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ttc29Q80VM3 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ttc29Q80VM3 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ttc29Q80VM3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ttc29Q80VM3 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ttc29Q80VM3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ttc29Q80VM3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ttc29Q80VM3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ttc29Q80VM3 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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